*) На ноде сервера должны быть системные DCI-и, проверьте "Average length of database writer's request queue for last minute" - это количество запросов, которое провисело в очереди на запись в базу. Если сильно (и постоянно) больше нуля - проблема именно тут.
*) Проверьте настройки постгреса ("из коробки" он очень консервативен по ресурсам - и ужасно медленный): количество выделенной памяти, включен ли stats_start_collector/stats_row_level/autovacuum. Сделайте "vacuum full analyze" при остановленном netxms сервере.
*) Попробуйте доставить памяти до 512/гигабайта (и половину отдать постгресу)
*) Как вариант - поставить mysql на myisam, он быстрее на запись чем постгрес или mysql на innodb. В этом варианте желательно часто бекапится