Проблема снята. Что было - непонятно. Видимо инсталлятор по каким то причинам не находил установленную Java машину.
Но одно отличие все же было (вдруг имеет значение): переустановил не от имени администратора, а от имени пользователя, согласившись с UAC.
ну пропускает ли твой RAID через себя SMART от дисков - большой вопрос... потесть чем нить типа smartctl. если получится - то можно пробовать в NX затащить.