В свойствах интерфейсов на закладке Polling есть Expected state. По умолчанию он выставляется в то состояние, в котором был интерфейс при его создании. Можно там поставить IGNORE тогда события, что интерфейс ушел в DOWN не должны создаваться.
Массовое изменение можно сделать в hook::ConfigurationPoll скрипте - там нужно будет в цикле проходить по всем интерфейсам ноды.
Или вручную запустить скрипт, который пройдет по всем нодам и по интерфейсам. А для новых интерфейсов, создаваемых в системе добавить обработку в Hook::CreateInterface